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Le attività di ricerca del DIEM possono essere classificate in aree tematiche, facenti capo ciascuna ad un settore scientifico disciplinare. Caratteristica peculiare di tali attività è quella di collocarsi spesso trasversalmente rispetto ai macro-settori ingegneristici che convergono al Dipartimento.
Il Dottorato di Ricerca costituisce il più alto livello dell'istruzione superiore universitaria. Presso il DIEM è costituito il Dottorato di Ricerca in Meccanica e Scienze Avanzate dell’Ingegneria (DIMSAI), afferente alla Scuola di Dottorato in Ingegneria Industriale ed articolato nei seguenti quattro indirizzi culturali - Progetti – tesi ad accorpare le tematiche culturalmente più affini: